Аспирантура Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра «Институт общей физики им. А.М. Прохорова Российской академии наук» (ИОФ РАН) готовит аспирантов по следующим специальностям:
Укрупнённая группа направлений подготовки «03.00.00 Физика и астрономия» состоит из одного единственного направления подготовки «03.06.01 Физика и астрономия». Укрупнённая группа направлений подготовки «11.00.00 Электроника, радиотехника и системы связи» состоит из одного единственного направления подготовки «11.06.01 Электроника, радиотехника и системы связи». См. приказ Минобрнауки № 1192 в разделе Официальное.
Оба перечисленных выше направления подготовки в аспирантуре включены в Перечень специальностей и направлений подготовки высшего образования, соответствующих приоритетным направлениям модернизации и технологического развития российской экономики.
В списке выше пометкой (ФГОС) отмечены те специальности, по которым в ИОФ РАН ведётся подготовка по стандартам ФГОС. По ФГОС обучаются аспиранты, принятые 1 сентября 2014 года или позднее. Для этих специальностей имеются предусмотренные стандартами ФГОС общие образовательные программы аспирантуры ИОФ РАН, см. раздел Учёба.